日期 | 授课题目 | 课程内容 |
6月28日 | R语言基础知识 | 1、R语言概述及特点 |
2、R语言软件安装和功能介绍 | ||
3、R语言包的安装和帮助文档 | ||
R语言的编程 | 1、介绍R语言中常用的数据结构(包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等)的介绍和操作方法; | |
2、R语言中数据的导入导出 | ||
3、R语言编程中常用的控制语句 | ||
4、R语言中功能模块(函数)的编写和使用方法。 | ||
6月29日 | R绘图基础 | 1、R绘图的基本概念和模式 |
2、R语言中常用绘图函数和绘图参数的介绍 | ||
3、使用专门的绘图包进行绘图 | ||
ggplot2的使用 | 1、ggplot2软件包概述 | |
2、ggplot2绘制简单图形 | ||
3、ggplot2绘制复杂图形,并进行参数调整 | ||
6月30日 | R在统计学中的应用 | 1、使用R做统计分析,假设检验,包括2、常用的参数和非参数检验; |
3、使用线性模型进行回归分析; | ||
4、使用R做方差分析; | ||
5、使用R做主成分分析和聚类分析等 | ||
7月1日 | R在生物信息学分析中的应用 | 1、使用R语言分析转录组测序的read count数据,进行差异表达分析; |
2、使用R进行基因的GO富集分析和Pathway分析等。 | ||
答疑 | 具体问题讨论和现场答疑,可以结合学员自身数据和分析需求,设计和编写R语言脚本 |