在一项新的研究中，来自美国威尔康奈尔医学院、纪念斯隆凯特琳癌症中心、加拿大英属哥伦比亚大学和IMAXT联盟的研究人员利用单细胞测序揭示了乳腺癌和卵巢癌相关的突变过程。相关研究结果于2022年10月25日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Single-cell genomic variation induced by mutational processes in cancer”。在这篇论文中，他们描述了他们如何对成千上万个乳腺组织细胞进行单细胞基因组测序，并将他们的发现与他们对成千上万个卵巢肿瘤和乳腺肿瘤细胞样本进行的测序进行比较。

这些作者在注意到可能在多种癌症中引发基因组不稳定的细胞间拷贝数改变还没有被科学界很好地解决后开始了他们的研究。他们还注意到，在不同种类癌症的进化过程中，这种改变能够导致表型变化的方式也没有得到充分的研究。为了纠正这种情况，他们开始了一项雄心勃勃的测序工作，最直接地关注与卵巢癌和乳腺癌有关的突变过程。

这些作者的研究工作是双管齐下的。其中的一项实验涉及对13800个乳腺上皮细胞进行单细胞基因组测序，这些细胞来自可能存在或不存在p53、BRCA1或BRCA2突变的女性，这些突变会导致同源重组缺陷。他们随后通过观察单倍型模式和单细胞结构变异（structural variant）来寻找突变过程。

第二项实验是对22057个晚期卵巢癌或乳腺癌的肿瘤细胞进行单细胞基因组测序。他们随后将在第一项实验中发现的模式（他们称之为前景事件）与第二项实验中发现的模式进行了比较。

在单细胞基因组中产生细胞间变异的过程。图片来自Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-05249-0。

在他们的比较中，这些作者发现了他们所描述的细胞拷贝数和结构变异的变化，这些变化在三阴性乳腺癌和高级别浆液性卵巢癌（serous ovarian cancer）中广泛存在，这些变化在独特的不稳定性过程中被看到。他们进一步提出，这种改变表明对数百个基因的表达水平有影响。他们还在他们研究的细胞中发现了其他差异，这可能有助于阐明导致卵巢癌和乳腺癌产生的许多过程。（生物谷 Bioon.com）

参考资料：

Tyler Funnell et al. Single-cell genomic variation induced by mutational processes in cancer, Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-05249-0.