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会议报道News

CTC单细胞miRNA原位多重检测技术研究获进展

2023-02-06

在液体活检的研究中,基于表面上皮标志物(EpCAM和CK)的循环肿瘤细胞(CTC)检测策略应用较为广泛,但存在局限性。研究表明,CTC中的肿瘤相关miRNA与癌症的发生和发展具有高度相关性,具有成为肿瘤表征和鉴定标志物的潜力。目前,高通量地针对单个CTC在活细胞水平开展原位分析,并进一步实现多个miRNA的同步分析,是颇具挑战性的工作。然而,新型的二维纳米材料——金属有机框架(MOF)因结构可控、...

Nature:揭示癌症中突变过程诱导的单细胞基因组变异

Nature:揭示癌症中突变过程诱导的单细胞基因组变异

2023-02-02

在一项新的研究中,来自美国威尔康奈尔医学院、纪念斯隆凯特琳癌症中心、加拿大英属哥伦比亚大学和IMAXT联盟的研究人员利用单细胞测序揭示了乳腺癌和卵巢癌相关的突变过程。相关研究结果于2022年10月25日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Single-cell genomic variation induced by mutational processes in cancer”。在这篇论文...

科研人员开发出拉曼介导靶向单细胞基因组技术

科研人员开发出拉曼介导靶向单细胞基因组技术

2023-02-02

海洋是地球上最大的活跃碳库。海洋微生物在全球碳循环中具有重要作用,而由于大部分海洋微生物尚难以培养、原位代谢功能难以测量等技术瓶颈,关于海洋微生物光合固碳的原位功能机制等重要问题存在争议。中国科学院青岛生物能源与过程研究所与英国牛津大学、英国谢菲尔德大学、山东省海洋科学研究院等合作,基于CO2固定活性靶向性的拉曼分选耦合单细胞基因组(scRACS-Seq)等仪器、手段,揭示了海水中原位进行光合固碳...

Nature子刊:韩敬东团队提出基于Transformer的单细胞可解释注释方法

Nature子刊:韩敬东团队提出基于Transformer的单细胞可解释注释方法

2023-02-02

近年来得益于单细胞测序技术的发展,我们可以以单细胞分辨率去理解生物学过程,包括发育,衰老和疾病等。细胞类型注释在单细胞数据分析过程中非常关键,传统的注释方法是将细胞降维到去除批次效应的低维空间,再进行一轮或多轮不同分辨率的聚类,最后根据不同细胞簇的标记基因人工的标注细胞类型。这一过程缺乏公认的标准,很大程度上受到研究人员偏好的影响。此外,移除批次效应的同时保留生物学差异也是单细胞研究的难点。幸而,...

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