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Nature:单细胞测序法为根治白血病开辟新途径

Nature:单细胞测序法为根治白血病开辟新途径

2021-08-06

 急性髓细胞性白血病(AML)是一类起源于白血病干细胞(LSC)的恶性克隆性疾病,但由于癌症干细胞的丰度低且与健康的造血干细胞(HSC)具有高度相似性而难以分离,因此阻碍了国际上针对靶向人体恶性细胞同时保留正常细胞的精密治疗方法的研究。近日,西班牙基因组调控中心(CRG)和欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员在《Nature Co  急性髓细胞性白血病(AML)...

研究解析拟南芥茎尖单细胞图谱

研究解析拟南芥茎尖单细胞图谱

2021-08-06

 高等植物个体由单个受精卵通过细胞分裂和分化而来。数量众多、功能多样的细胞组成了一套复杂而精密的调控系统。直径大小不足100 μm的茎尖分生组织(shoot apical meristem)具有细胞多能性,它是所有植物地上部分组织和器官的来源,维持植物的“无限生长”。茎尖分生组织干细胞如何通过特定的分裂与分化轨迹发育成为不同的组织和器官  高等植物个体由单个受精卵通过...

Protein & Cell:绘制出灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱

Protein & Cell:绘制出灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱

2021-08-05

海马体作为脑的重要组成部分,在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长,海马功能逐渐退化,导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂,细胞组成具有高度异质性,传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外,由于伦理及样本来源的限制,不同年龄阶段的健康人类海马组织很难获取,这在一定  海马体作为脑的重要组成部分,在学习和记忆...

Journal of Genetics and Genomics:单细胞分辨率绘制水稻幼苗叶和根的转录组图谱

Journal of Genetics and Genomics:单细胞分辨率绘制水稻幼苗叶和根的转录组图谱

2021-08-04

水稻作为重要的粮食作物,为全球一半以上的人口提供主粮;同时,水稻作为单子叶模式植物,其个体发育与细胞分化受到了科研人员持续和广泛的关注。细胞功能的分化常常可以体现为基因表达的差异。新兴的单细胞转录组测序技术使高通量探究细胞的功能分化成为可能。绘制水稻全苗单细胞转录图谱将为单子叶植物的研究工作提供关键的基础资源,为理解植物发育的转录调控  水稻作为重要的粮食作物,为全球一半以上的...

Science:利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式

Science:利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式

2021-08-04

一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合,可能会在哺乳动物胚胎发育过程中,通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象:一个受精2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自...

花生单细胞测序研究取得重要进展

花生单细胞测序研究取得重要进展

2021-08-03

近日,广东省农业科学院作物所科技人员在国际著名期刊《Plant Biotechnology Journal》 (JCR一区,IF9.803)在线发表花生单细胞基因表达研究成果,在国际上首次绘制了花生叶片单细胞基因表达图谱。作物所刘浩博士,联合培养研究生胡冬秀、杜普旋为共同第一作者。作物所洪彦彬研究员、陈小平研究员,国际半干旱热带作物研    近日,广东省农业...

Nature Communications:GapClust方法能够高效准确地从大量单细胞转录组中发现稀有细胞群体

Nature Communications:GapClust方法能够高效准确地从大量单细胞转录组中发现稀有细胞群体

2021-08-03

近日,国际知名期刊《Nature Communications》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院俞章盛团队的研究成果“GapClust is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profi   近日,国际知名期刊《Natu...

Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构域结构的算法

Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构域结构的算法

2021-08-02

 基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来,单细胞水平下的Hi-C研究成为三维  基因组DNA和组蛋白以特定的...

Science:在单细胞分辨率下揭示SARS-CoV-2感染期间发生的T细胞反应

Science:在单细胞分辨率下揭示SARS-CoV-2感染期间发生的T细胞反应

2021-07-30

导致COVID-19的冠状病毒SARS-CoV-2正在全球肆虐。根据美国霍普金斯大学的最新统计数据(https://coronavirus.jhu.edu/map.html),超过1.69亿人遭受SARS-CoV-2感染。SARS-CoV-2对所有感染者的影响不尽相同。在一项新的研究中,来自瑞士、意大利和澳大利亚的研究人员在单细胞分辨率下破译了COVID-19感染期间发生的T细胞反应。相关研究结果...

单细胞融合蛋白共表达方面最新研究成果

单细胞融合蛋白共表达方面最新研究成果

2021-07-30

近日,上海交通大学丁显廷教授和谢海洋助理研究员团队在Advanced Materials杂志上发表论文,报道了一种基于微芯片免疫印迹方法的单细胞转染效率分析芯片(scTAC),用于快速准确地分析数千个宿主细胞个体中外源基因的表达差异。scTAC不仅可以对单个细胞中外源基因表达活性的信息进行灵敏、快速、准确的分析,还可以用于稀有细胞转染效率的分析和转染方法的评近日,上海交通大学丁显廷教授和谢海洋助理...

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