新生儿出生后三天内肠道微生态中菌群分布研究

为了初步探讨新生儿出生后第1天和第3天肠道微生态中菌群分布的特点，同济大学附属第一妇婴保健院丁溢芳， 肖玲莉， 郭佳林， 等人选取2016年6月15日至2016年8月3日在同济大学附属第一妇婴保健院出生的50例单胎、健康新生儿为研究对象。采集新生儿粪便样本，按采集时间分为第1天（记为D1）组和第3天（D3）组，每组各50个。使用Illumina NexSeq高通量测序技术，对样本中所有细菌的16S rRNA基因的V4+V5区进行DNA测序，获得肠道菌群结构数据。

结果发现：100个粪便样本共检测到门25个，科119个，属227个，种159个。2组粪便样本中主要的门均为变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门和放线菌门。与D1组相比，D3组中厚壁菌门、拟杆菌门的相对丰度呈上升趋势（分别为0.27±0.03与0.41±0.05、0.07±0.01与0.09±0.03），放线菌门呈下降趋势（0.10±0.01与0.01±0.00），变形菌门变化不大（0.51±0.03与0.49±0.05）。2组的厚壁菌门、放线菌门的相对丰度比较，差异均有统计学意义（q值均为－0.01，P值均<0.05）。2组粪便样本中相对丰度前10的共有科为肠杆菌科、葡萄球菌科、肠球菌科、链球菌科和毛螺菌科。与D1组相比，D3组中肠杆菌科、葡萄球菌科、肠球菌科、链球菌科的相对丰度呈上升趋势（分别为0.25±0.02与0.46±0.06、0.07±0.02与0.12±0.03、0.04±0.02与0.10±0.04、0.03±0.02与0.06±0.01），毛螺菌科呈下降趋势（0.03±0.01与0.02±0.02）。2组中只有肠杆菌科相对丰度比较差异有统计学意义（q=0.00，P<0.05）。2组粪便样本中相对丰度前10的共有属为葡萄球菌属、肠球菌属、链球菌属、拟杆菌属和假单胞菌属。与D1组相比，D3组中寡养单胞菌属、丙酸杆菌属、不动杆菌属、芽孢杆菌属、鞘氨醇单胞菌属等需氧或兼性厌氧菌的相对丰度降低（分别为0.07±0.02与0.00±0.00、0.06±0.01与0.00±0.00、0.03±0.01与0.00±0.00、0.02±0.01与0.00±0.00、0.02±0.00与0.00±0.00，q值均为0.00，P值均<0.05），拟杆菌属、韦荣球菌属、副拟杆菌属等厌氧菌的相对丰度升高（分别为0.01±0.00与0.08±0.03、0.00±0.00与0.03±0.02、0.00±0.00与0.01±0.00，q值分别为0.01、0.01及0.00，P值均<0.05）。

2组中相对丰度最高的菌种均为大肠埃希菌，均可见少量的加氏乳杆菌、动物乳杆菌和两岐双歧杆菌。生后第1天的粪便样本，按分娩方式分为阴道分娩亚组和剖宫产亚组。2个亚组中相对丰度最高的属均为葡萄球菌属，其次为寡养单胞菌属。生后第3天粪便样本，按分娩方式和喂养方式分为阴道分娩+非纯母乳喂养亚组、阴道分娩+纯母乳喂养亚组、剖宫产+非纯母乳喂养亚组和剖宫产+纯母乳喂养亚组。其中，剖宫产+纯母乳喂养亚组以葡萄球菌属为绝对优势菌，与其他3个亚组（均以肠球菌属、拟杆菌属、链球菌属、葡萄球菌属为主要优势菌属）不同；而双歧杆菌属及Subdoligranulum仅出现在阴道分娩的新生儿粪便样本。

胎粪并非无菌，且生后3 d内的粪便虽然菌群构成不同，但有共有优势菌。同时，与生后第1天相比，生后第3天需氧或兼性厌氧菌的相对丰度逐渐下降，而厌氧菌的相对丰度逐渐上升。(生物谷Bioon.com）

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