转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA)。现在主流的非编码RNA又包括:circRMA,microRNAs,及lncRNAs。转录组学是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和 空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序(RNA-Seq)是指利用第二代高通量测序技术进行 cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。
基于高通量测序平台的转录组测序技术能够全面获得物种特定组织或器官的转录本信息,从而进行基因表达水平研究、新转录本发现研究、转录本结构变异研究等。通过对转录组测序数据的分析便能观察疾病发生过程中病灶部位内部的基因表达水平变化。在肿瘤研究中,使用RNA-seq技术也可以预测潜在的融合基因。同时,此项研究也能应用在新lncRNA预测和已知lncRNA表达水平研究中。
2018年,生物谷将与国家基因检测技术应用示范中心共同举办本次全转录组测序数据分析及案例实践班,同时,生物芯片上海国家工程研究中心也将作为协办方共同完成此次培训。
本次培训从生物信息基础语言入门培训,到各类RNA测序分析介绍,再到lncRNA的鉴定与功能推断,最后到R语言基础与作图。整个理论和实操的培训课程下来,相信您对全转录组的生物信息学应用和分析会有一个全面的理解和运用,这也是本次培训班的办学目的。
为此,我们热忱的邀请您参加本次培训班,与您相聚在上海!