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谢志平 研究员

上海交通大学

一条基本不依赖ATG基因的膜蛋白降解途径

谢志平 研究员

演讲题目:一条基本不依赖ATG基因的膜蛋白降解途径

上海交通大学

曾获国家自然科学基金委员会“优秀青年科学基金”,入选教育部“新世纪优秀人才计划”。长期以酵母为模式生物从事细胞生物学基本过程“细胞自噬”基本机制研究,在酵母生物工程、细胞信号转导、细胞器动态变化、亚细胞囊泡运输等方面具有丰富的研究经验。2001年于北京大学生物化学与分子生物学系获学士学位,导师茹炳根教授。2008年于密歇根大学安阿伯分校分子细胞发育生物学系获博士学位,导师Daniel Klionsky教授。2009年回国工作。2014年加入上海交通大学生命科学技术学院。

研究方向:细胞自噬(Autophagy)是对维持真核生物健康有关键作用的的一类亚细胞降解途径。该通路以囊泡运输的形式实现对胞内受损或冗余的大分子和细胞器的高效清除。研究表明,细胞自噬在生物体生长发育、免疫防御、细胞程序性死亡、肿瘤抑制等方面有非常重要的作用。本领域的研究兴起于上世纪90年代,现在是生命科学研究前沿发展最快的领域之一。 

本实验室的研究主要包括利用现代分子生物学、细胞生物学方法,寻找作用于自噬体形成过程的新基因,进一步揭示自噬体形成的分子机理,理清上游信号转导网络对细胞自噬的调节作用,研究细胞自噬在疾病发生过程中的作用,探索通过干预细胞自噬减缓或治愈疾病的可行性。 

发表论文:

2016年01月更新)(*为通讯作者):
通讯作者/第一作者论文:
• Zhu J, Deng S, Lu P, Bu W, Li T, Yu L*, Xie Z*. The Ccl1-Kin28 kinase complex regulates autophagy under nitrogen starvation. J Cell Sci. 2016 Jan1;129(1):135-44.
• Li D, Song JZ, Shan MH, Li SP, Liu W, Li H, Zhu J, Wang Y, Lin J, Xie Z*. A fluorescent tool set for yeast Atg proteins. Autophagy. 2015 Jun 3;11(6):954-60.
• Li D, Song JZ, Li H, Shan MH, Liang Y, Zhu J, Xie Z*. Storage lipid synthesis is necessary for autophagy induced by nitrogen starvation. FEBS Lett. 2015 Jan 16;589(2):269-76.
• Chen Y, Zhou F, Zou S, Yu S, Li S, Li D, Song J, Li H, He Z, Hu B, Björn LO, Lipatova Z, Liang Y*, Xie Z*, Segev N*. A Vps21 endocytic module regulates autophagy. Mol Biol Cell. 2014 Oct 15; 25(20):3166-77.
• Huang WP, Shintani T, Xie Z*. Assays for autophagy I: the cvt pathway and nonselective autophagy. Methods Mol Biol. 2014; 1163:153-64. (Book Chapter)
• Backues SK, Chen D, Ruan J, Xie Z*, Klionsky DJ*. Estimating the size and number of autophagic bodies by electron microscopy. Autophagy. 2014 Jan 1;10(1):155-64.
• Zou S, Chen Y, Liu Y, Segev N, Yu S, Liu Y, Min G, Ye M, Zeng Y, Zhu X, Hong B, Björn LO, Liang Y*, Li S* and Xie Z*. Trs130 participates in autophagy through GTPases Ypt31/32 in Saccharomyces cerevisiae. Traffic. 2013 Feb;14(2):233-46.
• Yu ZQ, Ni T, Hong B, Wang HY, Jiang FJ, Zou S, Chen Y, Zheng XL, Klionsky DJ, Liang Y, Xie Z*. Dual Roles of Atg8−PE Deconjugation by Atg4 in Autophagy. Autophagy. 2012 Jun;8(6):883-92.
• Yang J, Zhao Y, Ma K, Jiang FJ, Liao W, Zhang P, Zhou J, Tu B, Wang L, Kampinga HH, Xie Z*, Zhu WG*. Deficiency of hepatocystin induces autophagy through an mTOR-dependent pathway. Autophagy. 2011 Jul;7(7):748-59. )
• 王海燕,倪涛,谢志平*。“酵母中细胞自噬的研究进展”。中国细胞生物学学报(Chinese Journal of Cell Biology)2010, 32(6):829-39。特约综述。
• Xie Z, Nair U, Geng J, Szefler MB, Rothman ED, Klionsky DJ. Indirect estimation of the area density of Atg8 on the phagophore. Autophagy. 2009 Feb;5(2):217-20.
• Xie Z, Nair U, Klionsky DJ. Dissecting autophagosome formation: the missing pieces. Autophagy. 2008 Oct 1;4(7):920-2.
• Xie Z, Nair U, Klionsky DJ. Atg8 controls phagophore expansion during autophagosome formation. Mol Biol Cell. 2008 Aug;19(8):3290-8.
• Xie Z, Klionsky DJ. Autophagosome formation: core machinery and adaptations. Nat Cell Biol. 2007 Oct;9(10):1102-9. Review.

其他论文:
• Dong C, Lin Z, Diao W, Li D, Chu X, Wang Z, Zhou H, Xie Z, Shen Y, Long J. The Elp2 Subunit Is Essential for Elongator Complex Assembly and Functional Regulation. Structure. 2015 Jun 2;23(6):1078-86.
• Li H, Li J, Li Y, Singh P, Cao L, Xu L, Li D, Wang Y, Xie Z, Gui Y, Zheng X. Sonic hedgehog promotes autophagy of vascular smooth muscle cells. Am J Physiol Heart Circ Physiol 2012 Dec;303(11):H1319-31.
• Bartholomew CR, Suzuki T, Du Z, Backues SK, Jin M, Lynch-Day MA, Umekawa M, Kamath A, Zhao M, Xie Z, Inoki K, Klionsky DJ. Ume6 transcription factor is part of a signaling cascade that regulates autophagy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Jul 10;109(28):11206-10.
• Nair U, Yen WL, Mari M, Cao Y, Xie Z, Baba M, Reggiori F, Klionsky DJ. A role for Atg8-PE deconjugation in autophagosome biogenesis. Autophagy. 2012 May 1;8(5):780-93.
• Yi C, Ma M, Ran L, Zheng J, Tong J, Zhu J, Ma C, Sun Y, Zhang S, Feng W, Zhu L, Le Y, Gong X, Yan X, Hong B, Jiang FJ, Xie Z, Miao D, Deng H, Yu L. Function and molecular mechanism of acetylation in autophagy regulation. Science. 2012 Apr 27;336(6080):474-7.
• Nair U, Cao Y, Xie Z, Klionsky DJ. The roles of the lipid-binding motifs of Atg18 and Atg21 in the cytoplasm to vacuole targeting pathway and autophagy. J Biol Chem. 2010 Apr 9;285(15):11476-88.

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