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培训特色


课程特色

■ 讲师助教:

长期从事生物信息学教学或研究的老师,具有丰富的生物信息学分析及教学经验。

■ 授课方式:

小班线上授课,直播辅导+操作演示+11远程实操指导相结合。

■ 听课福利:

凡报名参加线上培训,可限时回看授课视频一个月,反复学习。

学员课后可通过微信群继续和老师交流,长期获得指导机会。


【课程介绍】

随着测序技术的发展和海量数据的涌现,大数据分析已经成为科研工作中不可或缺的技术手段,如何基于生物信息学的方法和工具筛选新型肿瘤标志物分子,助力科研成果的发表,肿瘤测序及大数据分析专家委员会将组织生物信息学教学和科研一线的教师和博士生团队开展线上远程培训,期望能帮助从事生物医学研究(基础医学、临床医学、生命科学)的同行们,将各自的科研工作与生物信息学技术密切的结合,拓展新的科研思路和开辟新的科研模式,专家委员会倾力打造“肿瘤标志物挖掘技术与应用体系课”,一共9大课程,本次推出3期培训课程,为进阶课程打好基础,这3期课程精讲22个肿瘤数据库,17个分析软件,5大多组学数据资源,全网最全0编程,尽力让参与的老师“不虚此行”。


课程一、肿瘤标志物研究的实用数据库资源(超过16小时理论+实操教学)

课程目标:一次掌握核心靠谱的数据库

突变数据库

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非编码RNA数据库

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表观遗传数据库

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互作数据库

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转录调控数据库

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课程常用的高通量数据及分析方法介绍(数据实例应用)(超过16小时理论+实操教学)

课程目标:实用的分析工具,助你数据分析时候乘风破浪

数据挖掘工具

weka介绍及实际操作(分类、聚类、组合分析):https://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/

ONCOMINE介绍https://www.oncomine.org/resource/login.html

功能分析软件

Davidhttps://david.ncifcrf.gov/

GSEAhttps://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp

GREAThttp://bejerano.stanford.edu/great/public/html/index.php

网络分析工具

Stringhttp://string-db.org/cgi/input.pl

Cytoscapehttps://cytoscape.org/

WGCNAhttps://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/Tutorials/

统计分析工具

SPSS

Metascapehttp://metascape.org/gp/index.html

生存分析

kaplan-merker plotterhttp://kmplot.com/private/

UALCANhttp://ualcan.path.uab.edu/index.html

GEPIAhttp://gepia.cancer-pku.cn/index.html

OncoLnchttp://www.oncolnc.org/

cBioPortalhttp://www.cbioportal.org/

LOGpchttp://bioinfo.henu.edu.cn/DatabaseList.jsp

MethSurvhttps://biit.cs.ut.ee/methsurv/

 

 

课程三、综合组学数据资源实操(结合、肿瘤标志物挖掘与应用实例)(超过18小时理论+实操教学)

课程目标:从思路设计到结果分析,全流程实战演练

1GEOSRAGTEx数据库介绍及数据下载

实操内容:

GEO芯片注释和合并

GEO2R工具介绍

GEO差异分析及作图

2TCGAICGC数据库介绍及数据下载

实操内容:

目标基因的mRNAlncRNAmiRNADNA甲基化、蛋白质的差异分析及作图

目标基因的mRNAlncRNAmiRNADNA甲基化、蛋白质之间的关联分析

目标基因的mRNAlncRNAmiRNADNA甲基化、蛋白质与临床特征间的关联分析

基于临床特征的亚组中目标基因各分子的分析

3、个性化课题思路设计及讨论

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【开课时间】

8月开课,课程1-3每班50人(首期课程),报满即开。注册报名后,我们将联系您告知开课事宜。


课程费用

课程1-3单次课程:2400元/人

课程1-3打包学习:4800元/人

团购价:1800元/人(3人及以上组团报名即可享受团购价)


现注册报名,购买100元课程预订票预定课程,即可抵扣200元!3人及以上团体购票请直接联系主办方:17321098232(电话同微信)。

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