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2018-08-24至2018-08-25 上海
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文路 副研究员

北京大学生物动态光学成像中心

肝癌与结直肠癌单细胞多重组学测序研究

文路 副研究员

演讲题目:肝癌与结直肠癌单细胞多重组学测序研究

北京大学生物动态光学成像中心

个人简介:文路,北京大学,副研究员。研究方向为单细胞基因组与表观基因组学。1998年-2000年就读于中南大学湘雅医学院,获临床医学学士、硕士学位(七年制本硕连读),2000年-2004年就读于中南大学医学遗传学国家重点实验室,获遗传学博士学位。2005年-2008年北京大学生命科学学院博士后,2009年-2010年中山大学生命科学学院讲师,2011年至今北京大学生物动态光学成像中心助理研究员、副研究员。共发表SCI论文29篇,作为第一作者(含并列第一作者)或通讯作者(含共同通讯作者)的研究论著发表在Cell Research, Nature Communication, Nature Protocol, Genome Biology, Developmental Biology, Genomics, Development, Growth & Differentiation等杂志,共15篇。代表性论著如下:

1.Wen L* and Tang F*. Single cell epigenome sequencing technologies. Mol Aspects Med. 2017, Sep 21 (Review,*通讯作者)

2.Wen L* and Tang F*. Single-cell sequencing in stem cell biology. Genome Biology, 2016, 17:71. (Review,*通讯作者)

3.Wen L#, Li J#, Guo H#, Liu X#, Zheng S, Wen L, Li J, Guo H, Liu X, Zheng S, Zhang D, Zhu W, Qu J, Guo L, Du D, Jin X, Zhang Y, Gao Y, Shen J, Ge H, Tang F, Huang Y, Peng J. Genome-scale detection of hypermethylated CpG islands in circulating cell-free DNA of hepatocellular carcinoma patients. Cell Research, 2015 (25): 1250-1264. (#第一作者)

4.Hou Y, Guo H, Cao C, Li X, Hu B, Zhu P, Wu X, Wen L, Tang F, Huang Y, Peng J. Single-cell triple omics sequencing reveals genetic, epigenetic, and transcriptomic heterogeneity in hepatocellular carcinomas. Cell Research. 2016 26(3):304-19. 

5.Wen L*, Tang F*. How to catch rare cell types. Nature, 2015, 525(7568):197-8. (Preview, Nature 2015 Editors' choice, *通讯作者)

6.Guo H, Zhu P, Guo F, Li XL, Wu X, Fan X, Wen L*, Tang F*. Profiling DNA methylome landscapes of mammalian cells with single-cell reduced-representation bisulfite sequencing. Nature Protocol, 2015(5): 645-59. (*通讯作者)

7.Wen L#, Li X#, Yan L#, Tan Y#, Li R, Zhao Y, Wang Y, Xie J, Zhang Y, Song C, Yu M, Liu X, Zhu P, Li X, Hou Y, Guo H, Wu X, He C, Li R, Tang F, Qiao J. Whole-genome analysis of 5-hydroxymethylcytosine and 5-methylcytosine at base resolution in the human brain. Genome Biology. 2014, 15(3):R49. (#第一作者)

8.文路*,汤富酬. 单细胞转录组高通量测序分析新进展. 遗传, 2014, 36(11): 1069-1076. (综述,*通讯作者)

9.Gan H#, Wen L#, Liao S#, Lin X, Ma T, Liu J, Song CX, Wang M, He C, Han C, Tang F. Dynamics of 5-hydroxymethylcytosine during mouse spermatogenesis. Nature Communication. 2013 Jun 13; 4:1995. (#第一作者)


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