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魏冬青 教授

上海交通大学生命学院

花椒素的发现及其抗衰老作用

魏冬青 教授

演讲题目:花椒素的发现及其抗衰老作用

上海交通大学生命学院

个人简介:上海交通大学生命学院生物信息与生物统计系以及微生物代谢国家重点实验室教授,博士生导师。Springer SCI期刊"Interdisciplinary Sciences – Computational Life Sciences"主编,“J. Mol. Graph and Modeling”, "Molecular Simulation"等10家杂志编委。发表SCI文章200多篇,主编“计算机辅助药物设计”,“结构生物信息学”等专著9部,SCI引用超过5000次, H因子45。获得横山亮次(Yokoyama Ryōji)等奖项,2010-2011提名教育部十大科技进展。

长期从事生物信息学与计算机辅助药物设计的研究工作,开发了分子模拟与计算机辅助药物设计软件SAMM,构建了多个生物信息数据库,如小分子数据库,中药有效成分数据库,细胞色素P450酶多态性基因型-表型相关性数据库。利用支持向量机,神经网络和贝叶斯等非线性方法开发了多个统计预测模型以及基于web的软件工具并应用到药物组合,基于多靶标的药物筛选,药物代谢动力学和基因表型相关性的研究。

此外结构生物信息学方面做了大量的工作。利用同源建模的方法预测出了多个蛋白质的3D结构,丰富并完善了由序列到结构的结构生物信息学方法。系统开展了重要膜蛋白(Alpha7, PLN, M2 of Influenza A and B),DNA-蛋白体系(Sox2-Oct1-Hoxb1),以及重要工业用酶(脂肪酶T1 lipase)的分子动力学模拟研究,提出了DNA转录的Tethered-Hopping 模型,和药物小分子调控离子通道开关以及脂肪酶高温活性的分子机制。将计算机药物设计和中药有效成分等数据库应用到药物设计和分子优化的实践中,比如,病毒(SARS,HIV,H5N1,H1N1)和老年痴呆等疾病的药物设计。发现了花椒有效成分WGX-50的抗衰老作用,对CYP450酶进行了系统研究,从不同人的基因多态性出发,研究酶对药物代谢动力学的规律,对个性化用药和药物设计进行了初步探索。最近在A型流感病毒M2跨膜蛋白质子通道分子调控机制的研究中取得重要进展,成果发表在《美国化学会志》(JACS)上。它解释了相互矛盾的实验现象,有助于阐释药物调控离子通道的机理,对于药物设计有一定的指导作用。


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