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2017-09-15至2017-09-16 上海
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文路 副研究员

北京大学生物动态光学成像中心

单细胞三重组学深度测序技术分析肝癌与结直肠癌瘤内异质性

文路 副研究员

演讲题目:单细胞三重组学深度测序技术分析肝癌与结直肠癌瘤内异质性

北京大学生物动态光学成像中心

北京大学生物动态光学成像中心高级助理研究员 

研究方向为单细胞基因组与表观基因组学。

学习经历:1998年毕业于中南大学湘雅医学院,获临床医学学士学位,2000年毕业于中南大学湘雅医学院,获临床医学硕士学位(七年制本硕连读),2004年毕业于中南大学医学遗传学国家重点实验室,获遗传学博士学位。

共发表SCI论文19篇,作为第一作者(含并列第一作者)或通讯作者(含共同通讯作者)的研究论著发表在Cell Research, Nature Communication, Nature Protocol, Genome Biology, Developmental Biology, Genomics, Development, Growth & Differentiation等杂志,共11篇。


代表性论著如下: 
1. Wen L*, Li JY*, Guo HH*, Liu XM*, Zheng SM, Wen L, Li J, Guo H, Liu X, Zheng S, Zhang D, Zhu W, Qu J, Guo L, Du D, Jin X, Zhang Y, Gao Y, Shen J, Ge H, Tang F, Huang Y, Peng J. Genome-scale detection of hypermethylated CpG islands in circulating cell-free DNA of hepatocellular carcinoma patients. Cell Research, 2015 25(11): 1250-1264. (* co-first author) 
2. Hou Y, Guo H, Cao C, Li X, Hu B, Zhu P, Wu X, Wen L, Tang F, Huang Y, Peng J. Single-cell triple omics sequencing reveals genetic, epigenetic, and transcriptomic heterogeneity in hepatocellular carcinomas. Cell Research, 2016 26(3):304-19. 
3. Wen L#, Tang F#. How to catch rare cell types: How to catch rare cell types. Nature, 2015, 525(7568):197-8. (# corresponding author, Preview) 
4. Wen L#, Tang F#. Charting a map through the cellular reprogramming landscape. Cell Stem Cell. 2015 Mar 
5;16(3):215-6. (# corresponding author, Preview) 5. Guo H, Zhu P, Guo F, Li XL, Wu XL, Fna XY, Wen L#, Tang F#. Profiling DNA methylome landscapes of mammalian cells with single-cell reduced-representation bisulfite sequencing. Nature Protocol, 2015(5): 645-59. (# corresponding author) 
6. Wen L*, Li X*, Yan L*, Tan Y*, Li R, Zhao Y, Wang Y, Xie J, Zhang Y, Song C, Yu M, Liu X, Zhu P, Li X, Hou Y, Guo H, Wu X, He C, Li R, Tang F, Qiao J. Whole-genome analysis of 5-hydroxymethylcytosine and 5-methylcytosine at base resolution in the human brain. Genome Biology. 2014, 15(3):R49. (* co-first author) 
7. Wen L#, Tang F. Genomic distribution and possible functions of DNA hydroxymethylation in the brain. Genomics. 2014, 104(5): 341–346. (# corresponding author) 
8. 文路#,汤富酬. 单细胞转录组高通量测序分析新进展. 遗传, 2014, 36(11): 1069-1076. (# 通讯作者) 

9. Gan H*, Wen L*, Liao S*, Lin X, Ma T, Liu J, Song CX, Wang M, He C, Han C, Tang F. Dynamics of 5-hydroxymethylcytosine during mouse spermatogenesis. Nature Communication. 2013 Jun 13; 4:1995. (* co-first author)

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